MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 chromosome

Total Repeats: 3081

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017279	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017279	A	7	7	1358	1364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017279	ATT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017279	GAA	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017279	CAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017279	TTA	3	9	1437	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017279	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017279	GAA	2	6	4901	4906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017279	TA	3	6	6518	6523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017279	TTTTA	2	10	6527	6536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017279	TAAT	2	8	6559	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017279	TAAT	2	8	6568	6575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017279	A	7	7	6586	6592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017279	ATT	2	6	6596	6601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017279	TAAAA	2	10	6619	6628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017279	TCA	2	6	6629	6634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017279	TTA	2	6	6647	6652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017279	T	6	6	6666	6671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017279	ATT	2	6	6691	6696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017279	T	6	6	8033	8038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017279	ATTT	3	12	8040	8051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017279	A	7	7	8077	8083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017279	AAG	2	6	16431	16436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017279	A	6	6	16709	16714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017279	T	6	6	17413	17418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017279	GTATT	2	10	17431	17440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017279	A	7	7	17443	17449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017279	TAA	2	6	17463	17468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017279	AAAT	2	8	17497	17504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017279	A	6	6	17539	17544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017279	TTA	2	6	17545	17550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017279	AAAAT	2	10	19799	19808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017279	TTTA	2	8	19825	19832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017279	T	6	6	21103	21108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017279	AATTTA	2	12	21111	21122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017279	AAAAT	2	10	23623	23632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017279	GTTAA	2	10	23650	23659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017279	A	6	6	23669	23674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017279	T	6	6	27315	27320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017279	ATT	2	6	27350	27355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017279	T	7	7	27354	27360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017279	TGAT	2	8	27383	27390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017279	CAT	2	6	27406	27411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017279	T	6	6	28275	28280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017279	ATT	2	6	28283	28288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017279	TTTTAT	2	12	28295	28306	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017279	TAA	2	6	28317	28322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017279	T	6	6	28353	28358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017279	AAGG	2	8	29727	29734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017279	T	6	6	34283	34288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017279	T	6	6	34299	34304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017279	T	6	6	34317	34322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017279	A	7	7	34371	34377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017279	TTA	2	6	34384	34389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017279	TAA	2	6	37606	37611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017279	A	6	6	37616	37621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017279	A	6	6	37639	37644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017279	TTAT	2	8	37645	37652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017279	TGT	2	6	37654	37659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017279	T	6	6	38676	38681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017279	TATAT	2	10	38744	38753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017279	T	6	6	38760	38765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017279	C	11	11	38778	38788	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_017279	CCA	2	6	38799	38804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017279	TA	3	6	38811	38816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017279	T	6	6	38896	38901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017279	A	6	6	38903	38908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017279	TAG	2	6	38947	38952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017279	T	6	6	38999	39004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017279	T	6	6	39015	39020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017279	CTTTT	2	10	39031	39040	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017279	T	6	6	39049	39054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017279	TTA	2	6	39091	39096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017279	TAA	2	6	39179	39184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017279	CTTTT	2	10	39201	39210	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017279	GAA	2	6	39233	39238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017279	CTAT	2	8	39249	39256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017279	T	6	6	39259	39264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017279	GGC	2	6	39299	39304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017279	ACA	2	6	39409	39414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017279	TA	3	6	39494	39499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017279	GGTAA	2	10	39513	39522	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017279	GAT	2	6	39561	39566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017279	GCA	2	6	39610	39615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017279	GCA	2	6	39650	39655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017279	CGC	2	6	39657	39662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017279	GGA	2	6	39665	39670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017279	GAA	2	6	39706	39711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017279	CAG	2	6	39754	39759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017279	TGG	2	6	39913	39918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017279	CTG	2	6	39971	39976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017279	GTT	2	6	40064	40069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017279	GAA	2	6	40208	40213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017279	TGC	2	6	40288	40293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017279	GTC	2	6	40300	40305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017279	TCGTG	2	10	40309	40318	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017279	AGG	3	9	40408	40416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017279	GAC	2	6	40425	40430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017279	TCA	2	6	40437	40442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017279	AC	3	6	40463	40468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017279	CCT	2	6	40767	40772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017279	TAA	2	6	40788	40793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017279	AT	3	6	40814	40819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017279	TGA	2	6	40854	40859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017279	AGG	2	6	40917	40922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017279	CCA	2	6	40947	40952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017279	TTA	2	6	40954	40959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017279	A	6	6	41039	41044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017279	AAG	2	6	41055	41060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017279	TA	3	6	41080	41085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017279	ATTT	2	8	41123	41130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017279	T	6	6	41128	41133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017279	ATTTAT	2	12	41190	41201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017279	AT	4	8	41215	41222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017279	CAAG	2	8	41279	41286	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017279	TAA	2	6	41290	41295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017279	TCTTT	2	10	41337	41346	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017279	TAACT	2	10	41351	41360	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017279	AAG	2	6	41504	41509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017279	AAT	2	6	41555	41560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017279	A	6	6	41568	41573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017279	CTA	2	6	41580	41585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017279	TGG	2	6	41594	41599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017279	AAG	2	6	41663	41668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017279	TA	3	6	41725	41730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017279	GCG	2	6	41801	41806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017279	TAGC	2	8	41944	41951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017279	TGC	2	6	42257	42262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017279	GGA	2	6	42320	42325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017279	TC	3	6	42406	42411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017279	AT	3	6	42416	42421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017279	CAG	2	6	42530	42535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017279	GGC	2	6	42539	42544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017279	CGT	2	6	42558	42563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017279	AAC	2	6	42573	42578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017279	CTTA	2	8	42606	42613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017279	AGG	2	6	42647	42652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017279	AGC	2	6	42663	42668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017279	AAAG	2	8	42677	42684	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017279	AGTA	2	8	42737	42744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017279	TAAT	2	8	42860	42867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017279	AGG	2	6	43065	43070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017279	GGAT	2	8	43130	43137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017279	AGA	2	6	43138	43143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017279	CCGTA	2	10	43195	43204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017279	GGTG	2	8	43215	43222	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017279	GAA	2	6	43246	43251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017279	CT	3	6	43252	43257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017279	ACA	2	6	43346	43351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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